Die Kosten für die Schlauchmagen-Op sind zwar nicht gering, liegen aber in der gleichen Preisklasse wie Magenbypass Op. Es ist eine relativ teure Prozedur im Vergleich zu anderen Anwendungen wie z.B. Magenballon und Magenband.
Die Kosten der Schlauchmagen-Op können je nach einigen Faktoren variieren. Die Faktoren in diese Prozedur, die sich auf die Festlegung der verschiedenen Preise auswirken, sind die angewandte Technik, zusätzliche Erkrankungen des Patienten, der Erfolg des Chirurgen in diesem Bereich und das Zentrum, in dem der Eingriff durchgeführt wurde.